GeneChip

Affymetrix GeneChip 薀蓄

木曜日, 2 月 5th, 2009

ググれば他でも出てくるような話ですが、一応書いておきます。

[とりあえずRMAでノーマライズ]
setwd()なりメニューなりから、CELファイル(gz圧縮可)のあるディレクトリに移動して、
> e <- [...]

Gene Expression OmnibusからCELファイル付きのデータを探す

木曜日, 1 月 8th, 2009

AffymetrixのGeneChipでは、通称CELファイルと呼ばれる形式が、一般に流通する生データとなっています(本当の生データはスキャンイメージであるDATファイルですが)。パブリックなマイクロアレイ・データを掻 [...]

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