Archive for 1 月, 2009
« Previous EntriesヒトBACクローンIDのゲノムマッピング
土曜日, 1 月 31st, 2009とある事情で、結構な数のヒトBACクローンIDをNCBI Build 36.3にマッピングしなければならなくなったのですが、NCBI Map Viewer用に作成されたデータが使えそうです。
ftp://ftp. [...]
PICオシロスコープもどき 進捗
水曜日, 1 月 28th, 2009現在、PIC24HJ12GP202はFosc=59.0MHz (Fcy=29.5MHz)で動作中。ADCの動作周波数は規定の12%増しの14.75MHzとしています。FT232R経由のシリアル接続は、921600bp [...]
箱庭
火曜日, 1 月 27th, 2009
現在、こんな感じ。
上はFT232R、真ん中がPIC24HJ12GP202、下が74HC4040と32kb SRAM、右がLM6482 (単電源オペアンプ)です。
汚いなあ。
Rでfalse discovery rate (FDR)を計算する
火曜日, 1 月 27th, 2009マイクロアレイ解析で多重比較の補正を行いたいとき、定番はFDRでしょう。Rでは、
> p <- runif(100, 0, 0.3) # p値もどき
> p.adjust(p, "fdr& [...]
SOP、SSOPのはんだ付け
月曜日, 1 月 26th, 2009SOPやSSOPのはんだ付けは位置決めが面倒なのですが、事務用品のダブルクリップを使うと楽です。金属製のため放熱にもなり、一石二鳥でしょう。あまり強力なものだとICを破壊してしまうかもしれませんが、いままでFT232 [...]
GeneChip ノーマライズ手法開発用のベンチマークデータ
月曜日, 1 月 26th, 2009その昔、自分でノーマライズ手法を開発できないものかと思って調べたときに見つけたもの(すぐに頓挫しましたが)。Robust multi-array average (RMA)で有名なRafael A. Irizarryの [...]
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